離子色譜液體泄漏的原因有很多種，可能原因以及處理方法見下所示：
原因A. 接頭泄漏
處理方法：確定所有液體管子都連接緊密
原因B.液管破裂
處理方法：在破裂處切斷管子，并重新連接或更換管子。
原因C.進樣閥上的螺栓太松處理方法：按以下步驟擰緊壓力螺栓：
① 關泵，停止淋洗液流動
② 用手擰緊壓力螺栓
③ 打開流路，檢查是否泄漏，如泄漏，再將壓力閥栓擰緊注意：切勿用力過大，以免折斷
原因D.泵單向閥體松動
處理方法：確認單向閥穩固地安裝在泵頭上，如不是，則小心地用以開口扳手旋緊直至不泄露。
原因E.泵活塞密封圈損壞
處理方法：損壞的密封圈會引起泵頭活塞周圍的液體泄漏，流量會降低和不穩定。更換活塞密封圈。注意：關閉電源開關，防止泵突然運轉，導致柱塞斷裂。取下泵頭時，注意要小心垂直取下，不要有傾斜。
原因F.活塞破損
處理方法：如更換了活塞密封圈后仍有泵頭周圍持續漏液，說明活塞擦傷或破損更換活塞。注意：關閉電源開關，防止泵突然運轉，導致柱塞斷裂。當將泵頭取下時，注意要小心垂直取下，不要有傾斜。
原因G．壓力傳感器墊片處漏液
處理方法：均勻擰緊壓力傳感器的安裝螺絲，如果還漏液，有可能是壓力傳感器的密封圈損壞，更換密封圈。
